สำนักงานเลขานุการ สำนักพัฒนาวิชาการ ได้เริ่มจัดตั้งขึ้นในปีการศึกษา 2543 ตามแบบโครงสร้างการบริหารของมหาวิทยาลัย เป็นส่วนหนึ่งในหกหน่วยงานของสำนักพัฒนาวิชาการ ซึ่งมีหน้าที่เป็นหน่วยงานกลางของสำนักฯ ในการให้บริการงานธุรการ งานสารบรรณ งามพิมพ์ งานเอกสาร และงานประสานงานภายในและภายนอกให้มีประสิทธิภาพ

     ต่อมาในปีการศึกษา 2550 สำนักพัฒนาวิชาการได้ดำเนินการปรับโครงสร้างการบริหาร ซึ่งเป็นโครงสร้างปัจจุบัน ประกอบด้วย 4 หน่วยงาน ได้แก่ สำนักงานเลขานุการ แผนกหลักสูตรและมาตรฐานการศึกษา แผนกพัฒนางานวิชาการ และหน่วยประกันคุณภาพ

     ปัจจุบันในปีการศึกษา 2558 สำนักพัฒนาวิชาการได้ปรับโครงสร้างการบริหาร ซึ่งเป็นโครงสร้างปัจจุบัน ประกอบด้วย 5 หน่วยงาน ได้แก่ สำนักงานเลขานุการ แผนกหลักสูตรและมาตรฐานการศึกษา ศูนย์สหกิจศึกษา แผนกพัฒนางานวิจัยและสื่อการเรียนรู้ และแผนกพัฒนาการเรียนการสอน